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L’UCLouvain recherche un·e Ingénieur·e logiciel pour le développement d'une plateforme multi-omique (H/F/X)

Référence du poste : SF  31784
Publication interne et externe jusqu'au 16/07/2022

 

Pour l'Institut de Duve (DDUV), du Secteur des sciences de la santé (SSS)
Site principal :  au CBIO (Computational Biology and Bioinformatics), sur le site des Cliniques Universitaires Saint-Luc à Woluwe-Saint-Lambert.

Contrat sur ressources extérieures, à temps plein pour une durée déterminée (1 an, éventuellement renouvelable)

Entrée en fonction : dès que possible

 

Contexte / Mission


HYGIEIA est un projet novateur destiné à répondre aux énormes défis de la pandémie de COVID-19, mais également à d’autres situations de type pandémique ou à des maladies complexes non-infectieuses. HYGIEIA est une initiative des Cliniques Universitaires Saint-Luc et de l’UCLouvain soutenue par le Sofina Covid Solidarity Fund.

Le projet HYGIEIA s’inscrit comme un véritable pionnier de la médecine de demain, en s’appuyant sur la médecine des systèmes et sur les potentialités gigantesques de l’intelligence artificielle. De
ce fait, HYGIEIA nécessite le développement d’applications informatiques sur mesure pour la gestion des données cliniques et multi-omiques à haute dimensionnalité (génomique, protéomique,
transcriptomique…) générées dans le cadre du projet. De telles applications sont nécessaires pour établir des flux d’information harmonieux entre les différentes plateformes technologiques, ainsi
que pour permettre leur analyse par des algorithmes de bioinformatique.

Le/la candidat·e participera à l’élaboration et au développement de la plateforme informatique

Objectifs métier

 

Cette fonction est liée au métier de Chargé·e de missions techniques, selon le cadastre des métiers à l’UCLouvain, dont les objectifs sont :
 

  • Recevoir, comprendre et instruire les missions reçues (faisabilité, enjeux, contexte fonctionnel, timing…) 
  • Proposer des solutions techniques et réaliser ou suivre la réalisation des missions
  • Evaluer et faire évoluer les approches techniques pour les adapter à de nouveaux besoins

Activités

 

  • En tant qu’ingénieur·e logiciel full-stack, vous développerez les bases de données et les applications (interfaces Web) nécessaires au projet HYGIEIA, en ce compris l’analyse des besoins et l’architecture informatique.
  • Vous travaillerez en lien direct avec les plateformes technologiques déployées pour ce projet, ainsi qu’avec les bio-informaticien·nes chargé·es d’analyser les données.
  • Vous contribuerez aux recherches scientifiques menées conjointement par Saint-Luc et par l’UCLouvain dans le cadre du projet HYGIEIA.
  • Vous veillerez à développer des logiciels selon de hauts standards de qualité, avec une attention de tous les instants portée à l’interopérabilité des systèmes.

Qualifications et aptitudes requises

 

  • Master en sciences informatiques, Master d’ingénieur civil informaticien, Master bioingénieur, ou diplôme assimilé.
  • Expérience solide en programmation orientée-objet (Java ou C++).
  • Maîtrise des bases de données (PostgreSQL), des environnements GNU/Linux et du langage Python.
  • Connaissances en développement d’applications Web responsives (Spring, Bootstrap, Vue.js…).
  • Expérience avec les tests unitaires et d'intégration.
  • Autodidacte et autonome.
  • Bonnes compétences analytiques et de communication.
  • Français et anglais technique.
     

Les plus :
 

  • Vous avez une expérience transdisciplinaire, idéalement en lien avec le secteur médical.
  • Vous connaissez les standards d’interopérabilité techniques du monde médical (FHIR).
  • Vous possédez des notions de bio-informatique (R) et de statistiques épidémiologiques.
  • Vous êtes utilisateur·trice et contributeur·trice à des logiciels libres et open-source.
  • Vous portez un intérêt à l’orchestration de conteneurs d’applications (Kubernetes).
  • Vous souhaitez prolonger ce projet par une thèse de doctorat dans le domaine de l’intelligence artificielle pour les données génomiques.


 

Contact pour information


Sébastien Jodogne, chargé de cours à l’UCLouvain : sebastien.jodogne@uclouvain.be

 

L’UCLouvain met en œuvre une politique RH qui promeut l’égalité des genres, veille à l’égalité des chances et est attentive et respectueuse de la diversité. Pour toute question à ce sujet, merci de prendre contact à l’adresse :
jobs-diversite@uclouvain.be.

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